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根本矛盾是指贯穿于事物发展过程的始终并规定事物及其发展全过程的本质，并规定和影响这个过程其它矛盾的存在和发展的矛盾。主要矛盾是指处于支配地位的，对事物的发展过程起决定作用的矛盾，由于它的存在和发展，规定或影响着事物复杂矛盾体系中的其它矛盾的存在和发展。

二者的区别：主要矛盾仅指在事物发展过程中处于支配地位，起决定作用的矛盾，它未必贯穿事物发展过程的始终，可能只存在于或主要存在于事物发展过程中的某一阶段，在事物发展的全过程中主要矛盾可能会发生变化;而基本矛盾则贯穿于事物发展的全过程，它规定着这个过程的本质，在事物发展的全过程中不会发生变化。因此，不能把主要矛盾和基本矛盾混为一谈。此外，主要矛盾在事物发展的每个阶段上只有一对，而基本矛盾在事物发展的全过程中有时不仅仅是一对。

然而二者之间又存在着一定的必然联系，把二者截然分开也是不对的。

无论是主要矛盾还是基本矛盾，都在事物发展过程中起决定作用并规定和影响着其它矛盾的存在和发展。另外，主要矛盾在它存在的一定阶段从一定侧面表现着基本矛盾，而基本矛盾作为规定事物发展全过程的本质的矛盾则制约和影响着主要矛盾。例如，我国是社会主义社会，贯穿于社会主义社会全过程的基本矛盾是生产力和生产关系的矛盾。在社会主义初级阶段，生产关系与生产力的矛盾则表现为人民日益增长的物质文化生活需要同落后的社会生产之间的矛盾，这是我国现阶段的主要矛盾，它决定了我国现阶段的根本任务和工作中心。可见，贯穿事物发展全过程的基本矛盾和同一事物中的主要矛盾存在着密不可分的必然联系。