顺治五年(1648年)三月，贝子屯齐告发郑亲王济尔哈明当年拥立肃亲王豪格、后又包庇豪格的种种罪状。鉴拜等人谋立肃亲王之事也被同时告发。多尔衮借此兴起大狱，整拜以欲立豪格、与诸人盟晳等罪名论死；四月，待卫廓步梭又告发整拜在皇太极死时“擅发兵丁守门”，再次论死，所幸的是这两次他都得旨免死。鳌拜虽以大功凯旋，在短短数月间却被论死两次，可见其所受打击之严酷。

顺治七年(1650年)七月，多尔衮生病，贝子锡輸秉承其意，请顺治帝亲自去探视，多尔衮却以“违令渎请”加罪于他，并追究拜的包庇之罪，论死，后改免死罚赎、降卧。这年十一月，多尔衮去世，顺治开始亲政。顺治亲政后，整拜在政治上获得了新生。顺治闻知鳌拜、索尼等人曾经盟誓“一心为主，生死与共”，忠心耿耿，于是对鳌拜极为敬重，视其为心腹重臣。此后，鳌拜随侍顺治身边，直接参与管理国家各类事务。

历史上鳌拜是谁杀死的（鳌拜被杀了吗）

顺治十三年(1656年)，鳌拜旧伤复发，卧床不起，顺治亲临拜府邸探视。顺治十四年(1657年)冬，孝庄太后病重期间，顺治朝夕侍侯，整拜也不分昼夜在宮中待候，深获顺治帝的赞赏顺治十八年(1661年)一月八日，顺治帝驾崩，年仅八岁的玄烨即位，顺治帝留下遗诏，由索尼、遏必隆、苏克萨哈、整拜四大臣辅政。当时在四辅政大臣中整拜地位最低，但因索尼年老多病，遇必隆生性庸儒，苏克萨哈因曾是摄政王多尔衮的旧属，为其它辅政大臣所恶，因此整拜虽然屈居第四，由于资格老，军功高，常常气势夺人，擅权自重，日益骄横，开始走上专权的道路。

清初圈地时，多尔衮凭借摄政的便利，将冀东肥沃之地圈给正白旗，而在保定、河间、州等地别拨土地给镶黄旗。康熙五年(166年)，提出圈地应按八旗排列顺序，冀东的土地按顺序应归黄旗所有，要求和正白旗换地。户部尚书苏纳海、直隶总督朱昌祚、巡抚王登联为避免引起大骚动都反对换地。苏克萨哈属正白旗也坚决反对。整拜对苏纳海、朱昌祚、王登联三人极为恼怒，分别以“藐视上命拨地迟误，“纷更妄奏”的罪名，俱论死罪。康熙虽然年幼，但知道苏纳海等三人并没有什么大罪，于是没有答应整拜所奏，只是批准刑部拟定的处罚，即将三人各鞭一百，没收家产。鉴拜公然无所顾忌，最终竟矫旨将三人处死。然后，鳌拜强行换地。

康熙六年(1667年)六月，索尼病死。七月，康熙亲政。但此时索尼已故，苏克萨哈被杀，四大辅臣只剩下一个无足轻重的必隆，更加肆无忌惮，为所欲为。虽然康熙已经亲政，但是根本不把他放在眼里，并不想归政于他。鳌拜对康熙的皇权构成了严重的威胁，康熙决意铲除鳌拜集团。

康熙八年(1669年)五月，康熙设计将鳌拜擒获，宜布鳌拜三十条状，廷议当新，但念整拜历事三朝，效力有年，不忍加诛，仅命革职，籍没拘禁，其党羽或死或革。不久整拜死于禁所，其子纳穆福后获释。