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清朝一统后，知府仍为正四品，后来改为从四品。顺天府、奉天府均为正三品，不作知府，称为府尹。《清史稿·卷117·志92·职官志·三》中载：“府知府一人。初制正四品。乾隆十八年改从四品。府知府一人。初制正四品。乾隆十八年改从四品。同知，正五品。通判，正六品。无定员。其属：经历司经历，正八品。知事，正九品。照磨所照磨，从九品。司狱司司狱，从九品。各一人。又江苏检校、贵州长官司吏目，各二人。”

据乾隆、光绪《淮安府志》中记载，淮安府常设知府一员、山清里河同知一员、山安南岸河务同知一员、海防河务同知一员、桃源河务同知一员、山盱河务通判一员、军捕通判一员、桃源安清中河通判一员、高堰河务通判一员、淮安府通判一员、淮安府推官一员、经历一员、照磨一员、校验一员、儒学教授一员、附设训导一员、批验所大使一员、大军仓大使一员、税课司大使一员、千总八员、大河卫守备一员、千总六员以及两淮盐运使运判一员等。其他属县设置基本相仿。

清代历任淮安府知府名单依次如下：

知府即“太守”，又称“知府事”，是中国古代的地方职官名，在明清时期，是府级行政单位的最高行政长官。据古代正史职官志《百官志》记载，唐朝时已有相近的权变做法，宋朝时正式设立州、府级地方长官“知府事”，明朝时才最后有了以“知府”为名的地方官职，由于好古，士人经常雅称知府为太守。

清朝沿袭明制，没有大的变化，为从四品，宣布条教，兴利除害，决讼检奸。三岁察属吏贤否，职事修废，刺举上达，地方要政白督、抚，允逎行。”知府掌一府之政令，总领各属县，凡宣布国家政令、治理百姓，审决讼案，稽察奸宄，考核属吏，征收赋税等一切政务皆为其职责。