伊斯玛仪二世逝世后，奇兹尔巴什（什叶派土库曼武装）军队派系推举他的弟弟科达班达为下任沙阿。

波斯的宫廷不和让外国势力有机可乘。

乌兹别克人一度入侵伊朗东北部，其后被马什哈德总督击退。

萨法维王朝（萨法维王朝最著名的城市是）

与奥斯曼帝国的战争是科达班达统治时期最重要的事件。

奥斯曼帝国苏丹穆拉德三世在1578年对波斯萨非王朝发动战争，战事一直延至1590年。

维齐尔拉拉·穆斯塔法帕夏（LalaMustafaPasha)率先入侵格鲁吉亚和希尔凡，另一支由奥斯曼帕夏(OsmanPasha)和费尔哈德帕夏(FerhadPasha)率领的军队在1585年攻陷了大不里士。

科达班达派遣长子哈姆扎·米尔扎迎战，但他在作战期间遇害身亡，大不里士在此后20年一直受奥斯曼帝国管治。

当乌兹别克人大举入侵呼罗珊时，当地的乌兹别克基齐勒巴什派系领袖穆尔西德·古利汗认为推翻沙阿的时机已到，扶植科达班达的儿子阿拔斯·米尔扎，当时阿拔斯·米尔扎受到穆尔西德的保护。

穆尔西德和阿拔斯赶往加兹温，阿拔斯在1587年10月成为新任沙阿。

阿巴斯一世（又译阿拔斯一世）在幸存了宫廷阴谋了暗杀后于1587年登基。

他认识到他的军队已不适应新时代战争的需要，这时奥斯曼帝国多次击败波斯军队，占领了格鲁吉亚和亚美尼亚，而乌兹别克人则占领了东部的马什哈德和锡斯坦。

首先他于1590年与奥斯曼帝国达成和平协议，将西北地区让给奥斯曼帝国。

然后他雇佣了一位英国将军来重组他的军队，使它变为一支受薪的、训练良好的、类似于欧洲正规军的军队，他大批量引入了火药。

他首先向乌兹别克人开战，于1598年重占赫拉特和马什哈德。

然后他开始对奥斯曼帝国回击，到1622年他得以重占巴格达、伊拉克东部和高加索省份。

1602年他将葡萄牙逐出巴林，在英国海军的帮助下于1622年重占波斯湾中的霍尔木兹。

他扩大了与不列颠东印度公司和荷兰东印度公司之间的贸易关系。

这样一来阿巴斯对内也得以摆脱了对红头的依赖，加强了中央政府。

奥斯曼帝国与萨非帝国之间对伊拉克富饶的平原的争夺战持续了150年。

伊斯迈尔一世于1509年占领巴格达，但是1534年苏莱曼一世就攻占了巴格达，1623年萨非帝国再占巴格达，但是1638年穆拉德四世再次夺回。

1639年双方在席林堡（Qasr—e—Shirin)签署了一个条约来确定波斯与土耳其之间的边界。

直到今伊朗西北与土耳其东南的边界依然是当时确立的。

这场逊尼派与什叶派之间的拉锯战至当代反映在伊拉克的宗教分歧中。

1609年到1610年萨非帝国与库尔德人之间爆发了一场血腥的战争。

这场战争的原因是伊朗西北乌米耶湖附近地区的一座城堡。

当地的库尔德人酋长试图在奥斯曼帝国与萨非帝国之间保持独立，他重建这座城堡被萨非帝国看作是一个独立的姿态，因此威胁到了萨非帝国对其西北地区的统治。

许多其他库尔德人首领（包括马哈巴德的酋长）也开始从波斯独立。

从1609年11月到1610年夏，萨非军队对这座城堡进行了长久和血腥的围困战后城堡失陷。

阿巴斯下令对血洗整个省份并将许多库尔德人部落迁往呼罗珊。

直到当代在呼罗珊地区还有近170万库尔德人，他们是当时被迫迁居的库尔德人的后裔。

由于阿巴斯特别怕人刺杀他，他对他自己家里被怀疑的人非常残忍，这些人不是被杀就是被弄瞎。

他的一个儿子被因此处死，两个被弄瞎。

由于他的另两个儿子在他生前都死了，他1629年1月19日逝世时没有男的继承人。

从17世纪开始红头的势力开始衰弱，过去的民兵逐渐演化为管理机构和官僚。

一个新的商人阶层逐渐强大起来，他们主要有亚美尼亚人、格鲁吉亚人和印度民族组成。